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纳米孔技术公司iNanoBio推出快速传感器大幅提高测序速度

总部位于亚利桑那州斯科茨代尔的INanoBio是一家纳米孔测序技术初创公司,致力于提高DNA分析速度。

本周早些时候,该公司亚利桑那州立大学(Arizona State University)的分支机构表示,他们可以制造出以100兆赫速度读取电信号的传感器,其速度大约是现有纳米孔技术的100倍。

该公司首席执行官、场效应纳米孔晶体管(FENT)的发明者Bharath Takulapalli说:“我们制造了世界上最快的纳米孔传感器。”这是一个重要的里程碑,该公司最终目的是开发一个长读、高通量测序平台。“晶体管的性能比我预期的要好。从测序的角度来看,这个速度已经足够。”

该公司已经将其FENT与直径为50纳米的固态纳米孔配对,并已经找到了一种方法来制造小于5纳米宽的孔,就像测序设备所需要的那样。现在,它必须找到一种方法,将其快速FENT与更小的孔结合起来,进行规模化生产。

Weill Cornell Medicine公司测序技术专家克里斯·梅森说:“据报道,该技术确实比任何其他已知竞争对手的纳米孔采样率都要高,这是令人信服的。”

牛津纳米孔公司的测序技术是梅森所在实验室使用的平台之一。

深入的基准测试是下一个合乎逻辑的步骤,例如使用滴定测量的人类和微生物对照样本。

Wyss研究所和哈佛医学院教授George Church说:“与iNanoBio一起,我们的全部目标是尽可能的快。”。

牛津纳米孔技术是目前市场上唯一 一种基于纳米孔的测序方法,它必须使用聚合酶作为棘轮机制来减缓DNA通过蛋白质孔的速度,并给设备足够的时间,对每个DNA碱基进行电测量。

通过检测分子表面电荷的变化,iNanoBio理论上可以调用碱基而不会减慢它们的速度,只要设备具有足够高的采样率。Takulapalli指出,由于FENT的工作频率为100MHz,iNanoBio现在拥有了这种设备,其速度甚至可以达到1GHz。

iNanoBio于2007年从亚利桑那州立大学分离出来,在过去的几年里一直致力于固态概念的研究。

2019年,该公司从国防高级研究项目局Defense Advances Research Projects Agency 获得540万美元的拨款,开发用于表观遗传修饰测序的纳米孔技术。

这项拨款是Mount Sinai's Icahn School of Medicine牵头的2780万美元项目的一部分,该项目旨在开发一种利用血液样本快速分析表观遗传标记的设备,该设备在检测大规模杀伤性武器方面具有潜在的应用前景。

该公司目前已从2014年的8名员工增至17名,目标是在未来一年将规模扩大一倍以上。

Takulapalli还表示,他正在努力争取A轮融资,但拒绝提供更多细节。

该公司目前正致力于建立一个DNA测序平台,但可能需要多长时间才能实现尚不清楚。

下一个技术里程碑是用FENT与20纳米到30纳米孔配对来生产芯片,这一过程可能需要长达一年的时间。Takulapalli指出,该公司的制造方法是用铸造厂实际使用的硅片类型完成的,不仅仅是一个小型实验室的原型。但该公司经常提供过于乐观的时间表。

该公司尚未公开发布其技术数据。Takulapalli告诉Magigen,该公司的目标读取长度在100 kb至1 Mb之间,并希望以“原始读取准确度大于99%和共识准确度至少99.9%进入市场” .

梅森说:“将读取质量提高到Q20 [或99.9%的准确度] 以上是理想的,”但是,如果读取时间长,对于某些应用程序,即使Q15也可能有用。”

除了寻求资金合作伙伴外,他还表示该公司“开放与他人合作商业化”其技术。他说,该公司将首先瞄准研究市场,但会避开诊断市场,包括POC即时诊断。

纳米孔技术不仅仅是用于DNA测序。Takulapalli说:“它将能够进行蛋白质检测和蛋白质测序。“但是,这些不是我们关注的直接领域,以后,一旦我们开发了DNA测序仪,我们将开始研究蛋白质测序。”


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文章分类: IVDNEWS生物产业新闻
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