精准肿瘤学SaCas9完全性基因敲除Cpf1完全性基因敲除    SpCas9完全性敲除      传统条件性敲除            传统完全性敲除            基因敲除小鼠传统同源重组基因敲入SaCas9基因敲入         SpCas9基因敲入        Cpf1基因敲入            基因敲入小鼠ES囊胚注射嵌合体小鼠细胞产品        转基因小鼠    定点突变        CAR-T细胞    人源蛋白质PCA筛选      验证人源蛋白质相互作用人源蛋白质PCA检测人源蛋白质两两之间相互作用的PCA检测验证人源蛋白质共定位  全基因组甲基化测序分析动植物基因组重测序      人类全基因组重测序      外显子测序                    人类基因组测序    16S/18S/ITS扩增子测序细菌基因组测序          真菌基因组测序          小基因组测序              宏基因组测序              微生物基因组测序转录组测序分析    Small RNA测序    IncRNA测序        RNA测序分析      基因芯片              小鼠胚胎及相关产品      小鼠基因型鉴定            打靶载体构建                胚胎冻存                       8细胞胚胎注射          原核/胞质注射          常规囊胚注射             显微注射                        质粒选购载体自建

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美格生物

MAGIGEN

Small RNA测序


技术简介

Small RNA主要包括microRNAsiRNA (small interfering RNA)piRNA (piwi-interacting RNA)三类。Small RNA测序是基于illumina HiSeq2500测序平台,

研究特定组织在特定状态下的所有已知Small RNA,也可发现物种或组织特异Small RNA,并預测其靶基因,为研究Small RNA的功能及基因调控机制提供了有力工具。

测序流程

1.  Total RNA样品测序

2.   3’端接头连接

3.   5’端接头连接

4. 反转录cDNA合成

5.   PCR富集    

6.   PAGE胶回收纯化

7.     上机测序



    分析内容


    送样要求

    1、样本类型:RNA

    2、样本总量:≥5ug

    3、样本浓度:≥200ng/ul

    4、样本纯度:OD260/280=1.80-2.00RIN≥8.0

    5、样本保存期间切忌反复冻融,送样时请使用干冰运输。


    案例分享:BMC Genomics: Small RNA降解组联合分析鉴定玉米果穗发育过程中差异miRNA及其靶基因

    研究目的

    寻找与玉米果穗发育相关的miRNA及其靶基因,为阐明果穗发育过程中的分子调控机制奠定基础。

    材料方法

    玉米果穗发育4个阶段的小RNA测序以及降解组测序。

    研究结果

    找到了两条可能在玉米果穗发育过程中发挥关键作用的miRNA

    参考文献

    Liu H, Qin C, et al. Identification of miRNAs and their target genes in developing maize ears by combined small RNA and degradome sequencing. BMC Genomics.
    2014 Jan
    14;15:25. doi: 10.1186/1471-2164-15-25.


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