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全基因组甲基化测序分析WGBS

技术简介

  全基因组甲基化测序(WholeGenome Bisulfite SequencingWGBS),广泛应用于细胞分化、组织发育等基础机制研究,以及动植物育种、人类健康与疾病治疗等研究领域。

甲基化是基因表达的主要调控方式之一,研究染色体DNA的甲基化情况是了解基因调控的基础获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。用标准bisulfite方法处理DNA后,未甲基化的胞嘧啶C会脱氨基形成尿嘧啶U。经过PCR扩增,尿嘧啶U替换为胸腺嘧啶T,而发生甲基化的胞嘧啶C保持不变。我们以新一代高通量测序平台为基础,进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析,必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义,并为细胞分化、组织发育等基础机制研究,以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。

服务流程:

1.    基因组DNA提取

2.    Bisulfite转化

3.    文库富集

4.    高通量测序

5.    生物信息学分析


分析内容及流程:

1.    原始数据

2.    数据预处理、质控

3.    转化效率评估

4.    Mapping至参考基因组

5.    甲基化水平计算

6.    差异甲基化位点和区段筛选

7.    差异基因及CpG岛注释


送样要求

DNA样品总量:3ug(物种基因组1.5GB);

                   6ug(物种基因组3GB);

                           ≥7ug(物种基因组3.5GB);

项目周期

60个工作日(数据量600G

70个工作日以上(数据量600G

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