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16S/18S/ITS扩增子测序

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,目前主要是应用高通量测序技术对特定环境中特定遗传物质进行测序,如原核生物16S rDNA/rRNA,真核生物18S rDNA/rRNA或者rDNA-ITS,这些特定的遗传物质都包括进化保守性及进化可变区,因此通过对这些可变区的测序和比对分析,可以克服培养技术的缺点,获得不能分离培养的物种信息,从而全面精确地探究并揭示不同环境中物种的多样性。根据研究目的不同可细分为如下几个产品类型:

产品类型研究对象
16s  rDNA/rRNA细菌或古菌的多样性
18s rDNA/rRNA真核生物的多样性
ITS测序真菌的多样性
功能基因扩增子测序对特定基因的PCR产物进行测序


文章分类: 微生物基因组
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